曹操翻出这件旧案，目的是打击献帝，他强迫献帝下诏废除皇后，献帝不得已，只得违心下诏：“皇后伏寿出身卑贱，登显尊之位身处后宫，既没有贤良美德，又没有美好才华，却私下里怀有妒忌之想，包藏祸心，不能承天命，奉祖宗。”曹操命令御史大夫郗虑拿着皇帝的信物以及诏书到后宫向伏寿宣布决定，收缴伏寿的印绶，强行将她迁出中宫，移到别的宫室居住。

荀彧被免去朝廷的尚书令一职后继任者是华歆，郗虑去抓伏皇后，华歆是副手，他带兵直接进入宫中搜捕，献帝把伏皇后藏在夹壁墙中，但被华歆发现，华歆命人把墙砸开，把伏皇后弄了出来。献帝正跟郗虑坐着说话，伏皇后披头散发、光着脚被人拉了过来，她拽着献帝的手说：“就不能想办法让我不死吗？”献帝也悲愤难当，他对妻子说：“我都不知道自己能活到什么时候。”献帝转过头来对郗虑说：“郗公，天下难道有这样的事吗？”

伏皇后被关进宫廷里的监狱，最后幽禁至死。伏皇后与献帝所生的两个皇子也都被鸩杀，受此株连，伏氏一族男性中有100多人被杀，女性中有19人被流放到幽州刺史部涿郡。

一向比较能容人的曹操在处理董贵人、伏皇后事件上表现得十分严厉，这是他对此类事件的一贯态度所决定的，十多年前处理董承事件中他也是如此果断，甚至更为残酷，就连怀有身孕的董贵人也没有放过。

在曹操看来，可以接受战场上的降将，可以原谅背叛过自己的人，但不能容忍有人在身边搞阴谋。通过伏皇后事件曹操再次向世人表达了他在政治上的诉求，那就是凡涉及政治问题、政权问题他都不会有半点让步，无论是天子还是皇后，凡在政治上向他发起挑战的，都将受到无情打击。

还有一种解读，认为曹操此举是为自己的女儿当皇后扫清障碍。一年前，即建安十八年（213）的7月曹操有三个女儿同时被聘为贵人，她们的名字分别是曹宪、曹节和曹华。曹操有25个儿子，如果按照男女出生比例大致相当的算法，他的女儿也为数不少，但留下名字的只有这三个，其他知道名号的还有清河公主、金乡公主、安阳公主、高城公主等少数几个，其中清河公主是曹操的长女，嫁给了夏侯惇之子夏侯楙，安阳公主嫁给了荀彧之子荀恽，金乡公主嫁给了曹操自己的养子何晏。

在这三个女儿中，除曹宪年龄较长外，曹节和曹华年龄还小，暂时留在家中。第二年春天，献帝派太常卿王邑、宗正卿刘艾持节前往魏公国迎接其余二女入宫。仪式相当隆重，王邑、刘艾带着五位副手，以及黄门侍郎、掖庭丞、中常侍各二人，携带了“束帛驷马”等聘礼前来“魏公国”迎接，在魏公宗庙前授给两位贵人印绶，随后两位贵人到邺县城内的延秋门拜别父亲曹操，并在此登车。曹操派魏公国的郎中令、少府、博士、御府乘、黄厩令以及丞相府的有关人员侍送贵人。两位贵人到达许县附近的洧仓，暂时在此下榻。献帝派人迎接入宫，御史大夫郗虑及以下全体高级官员在宫中集会，招待魏公国使者在殿中饮宴。

到伏皇后事件发生前许县宫里刚刚有曹操三个女儿当贵人，所以伏皇后被废不由得不让人产生联想，这是不是一场策划好的阴谋？关于这样的说法在当时一定会议论纷纷。

对于这些议论，曹操干脆用行动直接给予了还击。

伏皇后被废的第二年，即建安二十年（215）的正月，曹操让献帝下诏册立曹节为新皇后。曹节是曹操进宫的三个女儿中年龄排在中间的一个，有史书说曹操的爷爷曹腾的父亲叫曹节，对此很多人表示怀疑，因为曹操的这个女儿也叫曹节，曹操总不可能会给女儿起个与她曾祖父相同的名字吧？所以有人解释，曹腾的父亲名叫曹萌，繁体字的“节”与“萌”很相近，造成了传抄的错误。

董承事件后曹操对献帝的后宫一直不放心，三十多岁的献帝也不是个肯于安分的人，如果再出一个董承那样的人，不知道会弄出什么事来。现在不管怎么说，女儿成了皇后，曹操对天子的控制更进了一步，他再也不用担心后宫里有人搞阴谋诡计了。